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在之前的推文中,我们为大家带来了启动子、编码蛋白、RBS的推荐,作为“Parts推荐”的最后一篇,本篇推送将会来介绍有关终止子的内容。
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关于终止子,你还记得多少呢?
终止子 (Terminator T) 是给予 RNA 聚合酶转录终止信号的 DNA 序列,位于 poly(A) 位点下游,长度在数百碱基以内。终止子可分为两类:第一类不依赖于蛋白质辅因子就能实现终止作用;另一类则依赖蛋白辅因子才能实现终止作用。前者一般富含 GC 碱基对,后者常有一段富含 AT 碱基对的序列,可形成一种二级结构,以阻止 RNA 聚合酶继续转录,并从 DNA 链上脱落,从而终止转录。
原核细胞转录终止机制的简化示意图
终止子的作用有强有弱,终止子的选择会直接影响mRNA的量。在实验中,经常需要更换不同的终止子,从而找到最“适合”目的基因的那一个。而终止子因为其序列和茎环结构较短,所以存在基因合成失败率较高的问题。
在本篇推文中,我们为大家筛选了几十种不同的终止子,助力大家更好地完成实验。
iGEM常用终止子
根据iGEM官方统计显示,使用最多的终止子有以下8种。
其中使用频率最高的BBa_B0015是由BBa_B0010和BBa_B0012组成的double terminator,它们被广泛用于各种合成生物学实验。
BBa_B0015 结构图
小熊猫常用终止子
2013 年发表的 Characterization of 582 natural and synthetic terminators and quantification of their design constraints [1]表征了582种不同来源的终止子。这篇文章利用表征数据来研究终止子序列如何影响其强度,从而提高不同强度的终止子在合成生物学设计中的可用性。
我们从中选择了部分终止子,用于日常实验设计。这些终止子具有不同的性质,可以满足不同的实验要求
那么从哪里获得这些终止子呢?
阅读公众号原文,点击相关购买链接,即可下单啦~
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参考
- ^Chen, Y. J., Liu, P., Nielsen, A. A. K., Brophy, J. A. N., Clancy, K., Peterson, T., & Voigt, C. A. (2013). Characterization of 582 natural and synthetic terminators and quantification of their design constraints. Nature Methods, 10(7), 659–664.https://doi.org/10.1038/nmeth.2515
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