LC-MS/MS蛋白质组学分析

唐伯狼乌

基于液相色谱串联质谱（LC-MS/MS）的蛋白质组学可以揭示定量蛋白质组的状态，从而提供深入了解相关细胞或组织生物化学状态的机会。蛋白质并不是孤立的分子而是具有三维结构的物质，并且协同其他蛋白质分子一起参与调控各种生命活动，它们的空间结构和模块构成与其表达水平同样重要。基于LC-MS/MS的蛋白质组学方法结合生物化学手段，对于研究蛋白质组的结构单位有很大帮助作用。
目前，随着高校液相色谱（HPLC）分离技术与质谱（MS）鉴定技术的升级与发展，液相色谱串联质谱（LC-MS/MS）已然成为蛋白质组学分析的主流技术。在LC-MS/MS蛋白质组学分析中，蛋白质可以从各种生物体中提取包括细菌、细胞、组织和体液，并酶解成多肽后进行LC-MS/MS检测。LC-MS/MS采用串联质谱，既能得到分子离子峰，又有碎片离子峰，因而可以用来对蛋白质进行定性和定量分析。串联质谱可以用不同的方式采集数据，最为广泛的是非靶向方法（如鸟枪法或DDA），虽然此法相对简单且可以应用于任意的样本，而无需事先对样本进行任何了解，但是获得的数据可能会因有一定随机性而丢失部分信息。相比之下，高度一致的方式采集靶向肽段碎片离子信息，虽会提高准确度和灵敏度，但被限制于一个相对较小范围内。此外，蛋白质组学的研究取决于实验技术策略、质谱的高分辨率和高灵敏度以及定量算法和软件更新；这些方法和技术为定量蛋白质组学提供了研究手段和技术保障。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台，Orbitrap Fusion质谱平台，Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，能够对各种样品中的蛋白质进行蛋白质质谱鉴定服务。您只需要将您的需求和样品寄给我们，我们会负责项目后续所有事宜，包括样品前处理、质谱分析、质谱原始数据分析和生物信息学分析。