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发表于 2019-5-14 21:23:35
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Ceriotti开发的GLE控温法可以在经典牛顿力学模拟中增加量子的零点能。而Path Integral MD + GLE就可以用不多的资源需求完美模拟原子核的量子力学效应,即隧道效应和零点能。原子间相互作用可以采用包含了量子极化效果的力场,比如AMOEBA(平衡态附近的分子)或者ReaxFF(可模拟化学反应)。这样,就可以模拟符合量子力学规律的原子分子系统。
PI+GLE见:PRL, 109, 100604 (2012)
AMOEBA:
https://pubs.acs.org.ccindex.cn/doi/10.1021/ct4003702https://pubs.acs.org.ccindex.cn/doi/10.1021/acs.jctc.7b01169ReaxFF:
https://www.nature.com/articles/npjcompumats201511其他极化力场:
https://pubs.acs.org.ccindex.cn/doi/abs/10.1021/acs.jctc.8b00603(这里边段勇、罗Ray、王Junmei三个人都是业内大佬。Junmei还是AMBER程序的主要编写者,特别是里边最难、最为用户喜爱的Particle Meshed Ewald部分。)
根据 @蘭一 版友的说法,确实存在能调用大量CPU的程序如CP2K。还有应用CPU+GPU并行也可以增加效率。据我所知哥伦比亚大学Schrodinger软件(全世界最贵)和普林斯顿相关团队就开发了相关程序。今天还看到这个:
New math techniques to improve computational efficiency in quantum chemistryLow-rank canonical-tensor decomposition of potential energy surfaces: application to grid-based diagrammatic vibrational Green's function theory |
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