早在2005年,耶鲁大学的生态学家Casey W. Dunn就根据管水母的组织水平和特性将它分成了两个亚目——Cystonectae和Codonophora。相对来说,Cystonectae发育过程和其他的管水母不同,并且机制也不太清楚,已知属于该种属的管水母只有5类。而Codonophora就属于常见的管水母了,这种聚集动物能分成明显的两个生长区域,两个区域都能在生命历程中通过出芽过程形成新的游动孢子。其中一个生长区域被称作泳体区(Nectosomal),主要负责产生泳钟;另一个则被称作管水母下体区(Siphosomal),这个部分要更加复杂,其中的游动孢子能蕴含更多的功能,比如捕食、繁殖和保护。